Bioinformática para el análisis de secuencias genómicas

1. Fundamentos de Bioinformática
  1.1. Introducción a la Bioinformática
     1.1.1. Definición, antecedentes y campo de aplicación.
     1.1.2. Importancia y evolución de la bioinformática.
     1.1.3. Aplicaciones en investigación y desarrollo.
   1.2. Bases de datos genómicos.
      1.2.1. Principales bases de datos: GenBank, EMBL, ENSEMBL.

2. Almacenamiento y obtención de secuencias
  2.1. Tipos de formato de texto de secuencias.
  2.2. Obtención de secuencias desde bases de datos.

3. Tecnologías de secuenciación
  3.1. Secuenciación tipo Sanger: Principios y aplicaciones.
  3.2. Secuenciación de Nueva Generación (NGS): Principios, plataformas y aplicaciones.
  3.3. Comparación de metodologías y selección según el estudio.
  3.4. Flujo de trabajo en proyectos de secuenciación
      3.4.1. Diseño de experimentos y preparación de muestras.
      3.4.2. Análisis de datos primarios y control de calidad.

4. Herramientas de análisis en Bioinformática
  4.1. BLAST.
  4.2. Alineamiento múltiple de secuencias.
     4.2.1. Homología de secuencias
     4.2.2. Identificación de secuencias conservadas.
  4.3. Simple Phylogenie para la Construcción filogenética.
  4.4. Herramientas de visualización y anotación
     4.4.1. Visualización de secuencias y alineamientos.
     4.4.2. Anotación de genomas: ORF finder, GenScan.

5. Bioinformática aplicada
   5.1. Aplicaciones de la bioinformática en genómica estructural y funcional.
   5.2. Estudio de casos: Aplicaciones en medicina, agricultura y medio ambiente.
   5.3. Ejemplos específicos: 
      5.3.1. Análisis del virus de la influenza mediante herramientas bioinformáticas.
      5.3.2. Estudio de mutaciones y su impacto en la estructura y función de proteínas.