Genética forense

1. Introducción a la identificación con ADN.
  1.1. Breve historia del ADN y la genética 
  1.2. Genética forense. 
     1.2.1. Primeras aplicaciones de la prueba forense de ADN. 
     1.2.2. Inicios de la genética forense en México y sus aplicaciones. 
  1.3. ¿Cómo se identifica en la práctica con ADN? 

2. Generalidades del ADN.
  2.1. Definición, características y funciones del ADN. 
  2.2. Composición biomolecular del ADN
  2.3. Tipos de ADN: nuclear y mitocondrial

3. Conceptos de importancia en el análisis genético forense.
  3.1. Gen, genoma, locus y alelos.
  3.2. Marcadores, mutaciones y tipificación genética.
  3.3. Perfil de ADN, heterocigoto y homocigoto.
  3.4. Polimorfismo.

4. Polimorfismo del ADN y marcadores genéticos de uso forense. 
  4.1. Tipos de polimorfismos de ADN
     4.1.1. Polimorfismos de secuencia (SNPs) y de longitud (STRs y VNTRs).
     4.1.2. Importancia de los STRs en la identificación individual.
  4.2. Repeticiones en tándem de ADN
     4.2.1. Clasificación según el número de nucleótidos repetidos: di-, tri-, tetra-, penta- y hexanucleótidos.
     4.2.2. Selección de loci STRs utilizados en genética forense por su alta variabilidad.

5. Marcadores autosómicos vs marcadores del cromosoma Y.
  5.1. Marcadores autosómicos (STRs autosómicos).
  5.2. Marcadores del cromosoma Y (STR-Y).
  5.3. Comparación entre marcadores autosómicos y del cromosoma Y.
  5.4. Ventajas y limitaciones del análisis del cromosoma Y.

6. Bioseguridad en el manejo de evidencia genética forense.
  6.1. Seguridad del personal.
  6.2. Manejo tiempo-espacio. 
  6.3. Buenas prácticas forenses.

7. Muestreo y análisis preliminar de indicios biológicos.
  7.1. Examen visual (luces forenses, luminol, Bluestar).
    7.1.1. Patrones de distribución de manchas 
  7.2. Técnicas de muestreo y selección de muestra (doble hisopo, hisopos de plástico, cinta adhesiva).
  7.3. Pruebas presuntivas y confirmativas (sangre, semen, saliva, pelo).
  7.4. Prevención de contaminación cruzada y control de calidad en la recolección.

8. Principales fuentes de obtención ADN humano en genética forense 
  8.1. Muestras de referencias (personas vivas): sangre, saliva, elementos filamentosos.
  8.2. Muestras de cadáveres: recientes, Cadáveres degradados o restos cadavéricos 
  8.3. Restos indubitados especiales 
  8.4 Indicios en casos de agresión sexual y/o investigaciones criminales 

9. Etapas para la obtención de un perfil genético: Extracción del ADN
  9.1. Primera fase de lisis celular (química, mecánica, enzimática, reactivos desnaturalizantes.
  9.2. Segunda fase. Purificación del ADN

  9.3. Métodos de extracción - purificación:
     9.3.1. Extracción por adsorción utilizando sales caotrópicas y membranas de sílica gel 
     9.3.2. Método de extracción diferencial.
     9.3.3. Método de extracción con perlas magnéticas. 
     9.3.4. Chelex.
     9.3.5. Swabsolution.
     9.3.6 FTA.
     9.3.7. Kit ADN IQ.

10. Cuantificación del ADN.
  10.1. Generalidades de la cuantificación.
   10.2. Principales kits comerciales  (Plexor, Quantifiler trio o duo. y Powerquant®).

11. Amplificación.
  11.1. Generalidades de la amplificación 
  11.2. Etapas de la amplificación: Desnaturalización, Alineación y Extensión. 
  11.3. Principales kits: Powerplex® Fusion 6C, Powerplex® Fusion,  Globalfiler y Yfiler, Powerplex® 21, Powerplex® Y23.

12. Electroforesis capilar.
  12.1. Generalidades y componentes de la electroforesis capilar.
  12.2. Principales analizadores genéticos: Secuenciador 3500 y 3130, Spectrum CE y  Spectrum compact CE.
  12.3. Nuevas tecnologias para la obtención de perfiles genéticos: RapidHIT y ANDE 
  12.4. NGS (Next Generation Sequencing) y su aplicación forense.

13. Interpretación de resultados.
  13.1. Electroferograma y sus componentes:
       13.1.1 RFUS. 
       13.1.2. BINS.
       13.1.3. Pares de bases (PB).
       13.1.4. Rango de tamaño. 
       13.1.5. Estándar.
       13.1.6. Escalera alélica. 
       13.1.7. Umbrales.
       13.1.8. Artefactos.
  13.2. Taller de lectura de perfiles genéticos.

14. Generalidades estadísticas
  14.1. Definición de estadística y probabilidad.
  14.3 Frecuencias alélicas.
  14.2. Likelihood Ratio (Relación de probabilidades).

  14.3. Cálculos básicos con el software Familias:
       14.3.1. Maternidades.
       14.3.2. Paternidades. 
       14.3.3. Hermandades.
  14.5. Bases de datos poblacionales y software de análisis.

15. Aplicación práctica integrada.
  15.1. Simulación de caso pericial: desde la muestra hasta la interpretación.
  15.2. Presentación de resultados en contexto judicial.
  15.3. Discusión de limitaciones y errores comunes.